全校共设有13所学院。其中本科生院两所，即哈佛学院与拉德克利夫学院；研究生院11所，即文理学院、商业管理学院、肯尼迪管理学院、设计学院、教育学院、法学院、神学院、医学院、牙医学院、公共卫生学院及大学扩展部等。
几个主要的研究生院的著名系、部有：
文理学院的生物化学与分子生物学系、生物科学部、应用科学部、计算机技术研究中心、地质学系、化学系等；
医学院的细胞与进化生物学系、微生物与分子遗传学系、神经生物学系、生物化学系、生物学与生物物理学系、药物学系、免疫学委员会、与MIT合建的健康科学部等；
公共卫生学院的微生物学系；
设计学院的建筑系和设计专业等；
教育学院的管理、计划和社会政策专业，教学、课程和学术环境专业，人的发展、阅读和咨询心理专业等。
重点学科：
几个主要的研究生院的著名系、部有：
文理学院的生物化学与分子生物学系、生物科学部、应用科学部、计算机技术研究中心、地质学系、化学系等；
医学院的细胞与进化生物学系、微生物与分子遗传学系、神经生物学系、生物化学系、生物学与生物物理学系、药物学系、免疫学委员会、与MIT合建的健康科学部等；
公共卫生学院的微生物学系；
设计学院的建筑系和设计专业等；
教育学院的管理、计划和社会政策专业，教学、课程和学术环境专业，人的发展、阅读和咨询心理专业等。
哈佛大学本科生课程中的生物、化学、地质学、数学、物理、经济学、英文、历史、政治科学、社会学、心理学在全美排名前5名。政府研究(Government Studies)、经济 (Economics)和社会研究(Social Studies)更为突出。 哈佛大学首推为美国最好的大学，赢来了举世公认的学术口碑和崇高的国际声誉。
哈佛商学院是美国的顶尖商学院，享有极高的国际声誉。每年美国大学商学院的MBA课程招生中哈佛商学院的申请人数是最多的（一直维持在6000人以上，而只录取800人左右），也是竞争最激烈的。

专业及学历
Major Name	专业名称	本科	硕士	博士
Women's Studies	妇女研究 [更多开设本专业的院校]
Virology	病毒学 [更多开设本专业的院校]
Theology/Theological Studies	神学/神学研究 [更多开设本专业的院校]
Theological and Ministerial Studies, Other	神学研究 [更多开设本专业的院校]
Theological Studies & Religious Vocations, Other	神学及宗教职业 [更多开设本专业的院校]
Teacher Education and Professional Development	师范教育和职业发展 [更多开设本专业的院校]
Statistics, General	统计学 [更多开设本专业的院校]
Sociology	社会学 [更多开设本专业的院校]
Social and Philosophical Foundations of Education	社会与哲学基础教育 [更多开设本专业的院校]
Social Sciences, Other	社会科学及相关 [更多开设本专业的院校]
Social Sciences, General	社会科学 [更多开设本专业的院校]
Slavic Lang. & Lit. (Other Than Russian)	斯拉夫语(除俄罗斯) [更多开设本专业的院校]
Russian Studies	俄罗斯研究 [更多开设本专业的院校]
Russian Language and Literature	俄罗斯语言文学 [更多开设本专业的院校]
Romance Languages, Literatures, and Linguistics	罗曼语言文学、语言学 [更多开设本专业的院校]
Religion/Religious Studies	宗教/宗教学研究 [更多开设本专业的院校]
Reading Teacher Education	阅读师范教育 [更多开设本专业的院校]
Public Policy Analysis	公共政策分析 [更多开设本专业的院校]
Public Health, Other	公共卫生及其它 [更多开设本专业的院校]
Public Health, General (MPH, DPH)	公共卫生 [更多开设本专业的院校]
Public Administration and Services, Other	公共管理和服务 [更多开设本专业的院校]
Public Administration	公共行政 [更多开设本专业的院校]
Psychology, General	心理学 [更多开设本专业的院校]
Political Science and Government, General	政治学及政府 [更多开设本专业的院校]
Plant Genetics	植物遗传学 [更多开设本专业的院校]
Physics, General	物理学 [更多开设本专业的院校]
Physical Sciences	自然科学 [更多开设本专业的院校]
Philosophy	哲学 [更多开设本专业的院校]
Organizational Behavior Studies	组织行为学 [更多开设本专业的院校]
Near and Middle Eastern Studies	中东研究 [更多开设本专业的院校]
Music, General	音乐 [更多开设本专业的院校]
Music History, Literature, and Theory	音乐历史、文学、理论 [更多开设本专业的院校]
Museology/Museum Studies	博物馆学/博物馆研究 [更多开设本专业的院校]
Medicine (MD)	医药学 [更多开设本专业的院校]
Medical Neurobiology	医学神经生物学 [更多开设本专业的院校]
Medical Microbiology	微生物医学 [更多开设本专业的院校]
Medical Immunology	免疫医学 [更多开设本专业的院校]
Medical Cell Biology	细胞生物医学 [更多开设本专业的院校]
Mechanical Engineering	机械工程 [更多开设本专业的院校]
Mathematics, General	数学 [更多开设本专业的院校]
Linguistics	语言学 [更多开设本专业的院校]
Liberal Arts and Sciences/Liberal Studies	自由艺术和科学 [更多开设本专业的院校]
Lib. Art & Sci., Gen. Stud. & Human., Oth.	文理与通识教育 [更多开设本专业的院校]
Law and Legal Studies, Other	法律与法律研究 [更多开设本专业的院校]
Law (LL.B., J.D.)	法律 [更多开设本专业的院校]
Landscape Architecture	园林 [更多开设本专业的院校]
Jurid. Sci./Legal Spec.	法律本科 [更多开设本专业的院校]
International and Comparative Education	国际比较教育 [更多开设本专业的院校]
Interior Architecture	室内建筑 [更多开设本专业的院校]
Industrial/Manufacturing Engineering	制造工程 [更多开设本专业的院校]
History, Other	历史及相关 [更多开设本专业的院校]
History, General	历史 [更多开设本专业的院校]
History and Philosophy of Science and Tech.	科学技术史 [更多开设本专业的院校]
German Language and Literature	德国语言文学 [更多开设本专业的院校]
Geophysics and Seismology	地球物理和地震 [更多开设本专业的院校]
Geology/Earth Science, General	地质学/地球科学 [更多开设本专业的院校]
Geological and Earth Sciences/Geosciences, Other	地质和地球科学/地球科学 [更多开设本专业的院校]
French Language and Literature	法国语言文学 [更多开设本专业的院校]
Forest Sciences	林业科学 [更多开设本专业的院校]
Foreign Languages, Literatures, and Linguistics	外语文学、语言学 [更多开设本专业的院校]
Evolutionary Biology	生物进化学 [更多开设本专业的院校]
Environmental/Environmental Health Engineering	环境卫生工程 [更多开设本专业的院校]
Environmental Design/Architecture	环境设计 [更多开设本专业的院校]
English Language and Literature/Letters, Other	英语语言文学及相关 [更多开设本专业的院校]
English Language and Literature, General	英语语言文学 [更多开设本专业的院校]
Engineering, General	工程 [更多开设本专业的院校]
Engineering Science	工程科学 [更多开设本专业的院校]
Elementary, Middle, & Secondary Ed. Admin.	小学,初中,高中教务管理 [更多开设本专业的院校]
Electrical, Electronics and Communications Eng.	电器、电子、通讯 [更多开设本专业的院校]
Educational/Instructional Media Design	教育/教学媒体设计 [更多开设本专业的院校]
Educational Psychology	教育心理学 [更多开设本专业的院校]
Educational Leadership & Administration, General	教育管理 [更多开设本专业的院校]
Education, Other	教育学及相关 [更多开设本专业的院校]
Education, General	教育学 [更多开设本专业的院校]
Economics, General	经济学 [更多开设本专业的院校]
East Asian Studies	东亚研究 [更多开设本专业的院校]
Earth and Planetary Sciences	地球与行星科学 [更多开设本专业的院校]
Divinity/Ministry (BD, MDiv.)	神学 [更多开设本专业的院校]
Dentistry (DDS, DMD)	牙科学 [更多开设本专业的院校]
Dental Services and Allied Professions, Other	牙科及专职专业 [更多开设本专业的院校]
Dental Clinical Sciences, General (MS, PhD)	牙科临床科学 [更多开设本专业的院校]
Curriculum and Instruction	课程与教学 [更多开设本专业的院校]
Counselor Education/School Counseling and Guidance	教育辅导/学校辅导 [更多开设本专业的院校]
Computer and Information Sciences, General	计算机信息科学 [更多开设本专业的院校]
Computer Science	计算机科学 [更多开设本专业的院校]
Comparative Literature	比较文学 [更多开设本专业的院校]
Classics and Classical Lang., Lit., & Linguistics	古典语言文学 [更多开设本专业的院校]
Civil Engineering, General	土木工程 [更多开设本专业的院校]
City/Urban, Community and Regional Planning	城市社区规划 [更多开设本专业的院校]
Chinese Language and Literature	汉语言文学 [更多开设本专业的院校]
Chemistry, General	化学 [更多开设本专业的院校]
Cell/Cellular Biology and Histology	细胞生物学 [更多开设本专业的院校]
Cell/Cellular Biology and Anatomical Sciences	细胞生物学与解剖科学 [更多开设本专业的院校]
Business/Managerial Operations, Other	商业/管理运作 [更多开设本专业的院校]
Business/Managerial Economics	商业经济学 [更多开设本专业的院校]
Business Operations Support & Secretarial Service	商业支持及秘书服务 [更多开设本专业的院校]
Business Administration/Management	工商管理 [更多开设本专业的院校]
Biophysics	生物物理 [更多开设本专业的院校]
Biology/Biological Sciences, General	生物学/生物科学 [更多开设本专业的院校]
Biological and Biomedical Sciences, Other	生物科学、生物医学及相关 [更多开设本专业的院校]
Biochemistry	生物化学 [更多开设本专业的院校]
Basic Medical Sciences, Other	基础医学 [更多开设本专业的院校]
Atomic/Molecular Physics	原子/分子物理学 [更多开设本专业的院校]
Astronomy	天文学 [更多开设本专业的院校]
Art/Art Studies, General	艺术/美术研究 [更多开设本专业的院校]
Art, General	艺术 [更多开设本专业的院校]
Architecture and Related Programs, Other	建筑及相关 [更多开设本专业的院校]
Architecture (BArch, BA/BS, MArch, MA/MS, PhD)	建筑学 [更多开设本专业的院校]
Architectural Urban Design and Planning	城市规划与建筑设计 [更多开设本专业的院校]
Applied Mathematics	应用数学 [更多开设本专业的院校]
Anthropology	人类学 [更多开设本专业的院校]
Animal Physiology	动物生理学 [更多开设本专业的院校]
Animal Genetics	动物遗传学 [更多开设本专业的院校]
Anatomy	解剖学 [更多开设本专业的院校]
American (United States) History	美国史 [更多开设本专业的院校]
African-American/Black Studies	非洲裔研究 [更多开设本专业的院校]
Adult and Continuing Education Administration	成人及继续教育管理 [更多开设本专业的院校]